新一轮“部市合作”将重点围绕培育新兴战略性产业、开展崇明生态岛绿色经济试点示范、实施技术创新工程、完善创新创业环境等方面展开。双方将在智能电网世博示范工程的基础上，共同推进智能电网上海示范区建设；扩大科技成果的世博会示范效应，加快发展新能源汽车、半导体照明、太阳能光伏、高性能宽带信息网等新兴战略性产业；继续共同推进国家上海生物医药科技产业基地的建设与发展，进一步完善产业服务体系，加速产业发展进程；共同筹建深海海洋科研与产业化基地，提升上海海洋科技创新能力、海洋资源开发能力和海洋权益维护能力，更好地服务国家深海战略实施，支撑上海海洋产业发展。