一是全面落实科技政策，引导企业自主创新。进一步加大资金、政策等方面的扶持力度，支持企业在调整结构、转变发展方式中增强自主创新能力，通过政策培训、讲座、宣传等方式，重点做好高新技术企业的组织申报和认定工作，加大“企业研究开发费加计扣除政策”的落实推进力度，引导企业加大科技投入。目前已有14家企业通过高新技术企业认定，且突破了在传统水产品加工、船舶制造等领域没有高新技术企业的历史。2008年全市企业共投入技术开发费6.42亿元，免税额达到860多万元，工业企业科技创新获市财政补助额度近1000万元，有效帮助企业实现税收减负。二是有序推进科技创新载体建设，提升企业自主创新能力。市科技局把企业研发中心建设作为扶持企业转型升级的重要载体来抓。目前，1.6万平方米的浙江海洋开发研究院研发大楼已启动建设，水产品检测、鱿鱼产业、盐业三家区域创新服务中心已启动建设，浙江（舟山）海洋高新技术产业园区已启动建设，还大力支持软件与创意产业园建设。三是组织重大科技专项，促进企业转型升级。市科技局增强服务意识，提高服务质量，组织大批重大科技专项在我市实施。2008年全市人均争取到省级以上科技项目经费数列全省各地市首位，2009年组织申报了93项省重大科技专项重大重点项目。